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Équiterre collabore avec des organismes publics ou des groupes environnementaux pour mener des activités de sensibilisation et de mobilisation, ainsi que des recherches en lien avec l'horticulture écologique ou l'usage des pesticides.
Il s'agit entre autres du Bureau de la consommation d'Industrie Canada qui a soutenu financièrement la réalisation de l'étude « Horticulture ornementale écologique : connaître le consommateur pour orienter les décisions », de la Fondation David Suzuki avec laquelle Équiterre s'est associé pour concevoir le rapport « Couper l'herbe sous le pied des pesticides » et de la Canadian Association of Physicians for the Environment.